Kostel Božího milosrdenství a sv. sestry Faustyny Kowalské byl postaven z iniciativy faráře R. D. Pavla Habrovce v návaznosti na jubilejní rok 2000, ve kterém byl papežem sv. Janem Pavlem II. ustanoven nový svátek Božího milosrdenství a svatořečena bl. Faustyna.
Základní kámen kostela posvětil 1. července 2002 brněnský biskup Mons. Vojtěch Cikrle.
Stavba kostela probíhala v letech 2005–2008 (galerii ze stavby kostela naleznete ZDE). Po dokončení byl kostel vysvěcen biskupem Mons. Vojtěchem Cikrlem v den svátku Božího milosrdenství v neděli 30. března 2008.
Galerii z žehnání kostela naleznete ZDE
Architektem kostela je pan Ludvík Kolek (1933 - 2021). Foto: L. Koukalová
Ztvárnění stavby vyjadřuje symboliku Božího milosrdenství, které obdarovává věřící podobně jako voda ze střechy stékající do kamenné pateny před vstupem. Chrám je spoluzasvěcen svaté Faustyně Kowalské (1905–1938).
V kostele se nachází křížová cesta, kterou namaloval akademický malíř Jiři Štourač. Nad kostelem se nachází venkovní křížová cesta. Jejím autorem je umělecký kovář Pavel Tasovský. Tvoří ji kamenné bloky osazené kovanými reliéfy. Jeho dílem je i monstrance na vrcholu střechy a mariánský symbol na věži.
Od 1. ledna 2009 byla pastorační péče o farnost Jámy včetně kostela ve Slavkovicích svěřena otcům pallotinům.
Tradice poutí do Slavkovic započala již v roce 2003 a do kostela putují věřící nejen z okolí, ale ze všech diecézí v České republice.
Od září 2021 jsou Slavkovice místem modlitby za jednotlivé diecéze.
12. června 2022 se ve Slavkovicích uskutečnilo zasvěcení České republiky Božímu milosrdenství.
